Mikroutvecklingen är baserad på förändringarna på en molekylär nivå som får arter att förändras över tid. Dessa förändringar kan vara mutationer i DNA, eller de kan vara misstag som händer under mitos eller meios i förhållande till kromosomer. Om kromosomerna inte är uppdelade på rätt sätt kan det finnas mutationer som påverkar cellens hela genetiska sammansättning.
Under mitos och meiose kommer spindeln ur centriolerna och fästas till kromosomerna vid centromeren under det stadium som kallas metafas. Nästa steg, anafas, hittar systerkromatiderna som hålls samman av centromeren som dras isär till motsatta ändar av cellen av spindeln. Så småningom hamnar de systerkromatiderna, som är genetiskt identiska med varandra, i olika celler.
Eftersom systerkromatider är exakta kopior av varandra, om de inte delar upp mitten, dupliceras vissa gener på kromosomen. När systerkromatiderna dras in i olika celler kommer cellen med de duplicerade generna att producera fler proteiner och överuttrycka egenskapen. Det andra gametet som inte har den genen kan vara dödligt.
Om ett misstag görs under meios som får en del av en kromosom att gå sönder och försvinner, kallas detta en radering. Om borttagningen sker inom en gen som är avgörande för en individs överlevnad, kan det orsaka allvarliga problem och till och med döden för en zygot som är gjord av det spelet med borttagningen. Andra gånger orsakar den del av kromosomen som går förlorad inte dödsfall för avkomman. Denna typ av radering ändrar de tillgängliga egenskaperna i genpool. Ibland är anpassningarna fördelaktiga och kommer att väljas positivt för under naturligt urval. Andra gånger gör dessa borttagningar faktiskt avkomman svagare och de kommer att dö av innan de kan reproducera och överföra den nya genen som ställts ner till nästa generation.
När en bit av en kromosom bryts förlorar den inte alltid helt. Ibland kommer en bit kromosom att fästas på en annan, icke-homolog kromosom som också har tappat en bit. Denna typ av kromosommutation kallas translokation. Även om genen inte är helt förlorad kan denna mutation orsaka allvarliga problem genom att generna kodas på fel kromosom. Vissa drag behöver gener i närheten för att inducera sitt uttryck. Om de har fel kromosom, har de inte dessa hjälpargen för att komma igång och de kommer inte att uttryckas. Det är också möjligt att genen inte uttrycktes eller hämmas av närliggande gener. Efter translokering kanske dessa hämmare inte kan stoppa uttrycket och genen kommer att transkriberas och översättas. Återigen, beroende på genen, kan detta vara en positiv eller negativ förändring för arten.
Ett annat alternativ för en kromosom som har gått sönder kallas inversion. Under inversion vänds kromosomstycket runt och fästs fast vid resten av kromosomen, men upp och ner. Om inte generna behöver regleras av andra gener via direktkontakt, är inversioner inte lika allvarliga och får kromosomen ofta att fungera korrekt. Om det inte har någon effekt på arten betraktas inversionen som en tyst mutation.