39 år gammal blev Joe Clark Canadas yngsta premiärminister 1979. En finanspolitisk konservativ, Joe Clark, och hans minoritetsregering besegrades efter bara nio månader vid makten på ett icke-förtroendeförslag till en budget för skatteökningar och programnedskärningar.
Efter att ha förlorat valet 1980 stannade Joe Clark kvar som oppositionsledare. När Brian Mulroney tog över som ledare för det progressiva konservativa partiet i Kanada 1983 och sedan premiärminister Minister 1984 fortsatte Joe Clark som en effektiv minister för yttre förbindelser och minister för konstitutionell Affairs. Joe Clark lämnade politiken 1993 för att arbeta som en internationell företagskonsult, men återvände som ledare för det progressiva konservativa partiet från 1998 till 2003.
Joe Clark började sin politiska karriär som chef för organisationen för Alberta Progressive Conservative Party från 1966 till 1967. Han var specialassistent för en konservativ parlamentsledamot Davie Fulton 1967. Han tjänade som verkställande assistent för en konservativ parlamentsmedlem Robert Stanfield från 1967 till 1970.
Joe Clark valdes först till House of Commons 1972. Han valdes till ledare för det progressiva konservativa partiet i Kanada 1976 och var ledare för oppositionen fram till 1979. Joe Clark svarades in som Canadas premiärminister efter allmänna valet 1979.
Den konservativa regeringen besegrades 1980. Joe Clark var återigen ledare för oppositionen 1890 till 1983. Joe Clark kallade till ett Progressive Conservative Party-ledarskapskonvention och förlorade partiledningen för Brian Mulroney 1983.
I Mulroney-regeringen tjänade Joe Clark som minister för utrikesfrågor från 1984 till 1991. Han var ordförande för Privy Council och minister ansvarig för konstitutionella frågor från 1991 till 1993. Joe Clark deltog inte i valet 1993.
Joe Clark återvände som ledare för det progressiva konservativa partiet i Kanada 1998. Han omvaldes till underhuset 2000. 2002 sade Joe Clark att han hade bära det progressiva konservativa partiet så långt han kunde. Joe Clarks avgång som ledare för det progressiva konservativa partiet var effektivt vid ledningskonferensen i maj 2003.